CRISPR Libraries
VectorBuilder는 CRISPR 기반 스크린을 위해 사전 제작된 고품질 gRNA 렌티바이러스 라이브러리를 제공합니다. 이러한 라이브러리는 전체 게놈에서 pathway에 이르기까지 다양한 규모로 유전자 녹아웃은 물론 유전자 상향 또는 하향 조절을 가능하게 합니다. CRISPR 스크리닝을 수행하기 위한 강력하고 가성비 높은 방법입니다. 또한 귀하의 연구에 맞는 맞춤형 CRISPR 라이브러리를 구축할 수도 있습니다.
제공되는 CRISPR lentivirus libraries
- Whole-genome CRISPR knockout libraries
- Whole-genome CRISPRa libraries
- Whole-genome CRISPRi libraries
- Pathway-specific CRISPR knockout libraries
주문 정보
Note:
1. CRISPR 라이브러리의 기본 결과물은 바로 사용할 수 있는 렌티바이러스로 제공됩니다. 자세한 렌티바이러스 스케일 정보는 여기를 클릭하세요.
2. 주문을 하거나 라이브러리 디자인을 맞춤화하고 싶다면 디자인 서포트 의뢰하기를 요청하세요.
Whole-genome CRISPR knockout libraries
| Product Name | No. of Genes | No. of gRNAs | Scale | Price (USD) | Reference |
|---|---|---|---|---|---|
| Human Whole-Genome Dual-gRNA LibraryHOT | 20,048 | 91,926 (pairs) | Medium | $2,999 | View |
| Plus | $3,499 | ||||
| Mouse Whole-Genome Dual-gRNA LibraryHOT | 20,493 | 90,344 (pairs) | Medium | $2,999 | |
| Plus | $3,499 | ||||
| Human GeCKO V2 Library A | 19,050 | 65,383 | Medium | $1,999 | View |
| Plus | $2,499 | ||||
| Human GeCKO V2 Library B | 19,050 | 58,028 | Medium | $1,999 | |
| Plus | $2,499 | ||||
| Human GeCKO V2 Library A + B | 19,050 | 123,411 | Medium | $2,999 | |
| Plus | $3,499 | ||||
| Mouse GeCKO V2 Library A | 20,611 | 67,405 | Medium | $1,999 | |
| Plus | $2,499 | ||||
| Mouse GeCKO V2 Library B | 20,611 | 62,804 | Medium | $1,999 | |
| Plus | $2,499 | ||||
| Mouse GeCKO V2 Library A + B | 20,611 | 130,209 | Medium | $2,999 | |
| Plus | $3,499 | ||||
| Human Whole-Genome CROP-seq KO Library | 19,050 | 123,411 | Medium | $4,099 | |
| Plus | $4,599 | ||||
| Mouse Whole-Genome CROP-seq KO Library | 20,611 | 130,209 | Medium | $4,099 | |
| Plus | $4,599 | ||||
| Human Whole-Genome Perturb-seq KO Library | 19,050 | 123,411 | Medium | $4,999 | |
| Plus | $5,499 | ||||
| Mouse Whole-Genome Perturb-seq KO Library | 20,611 | 130,209 | Medium | $4,999 | |
| Plus | $5,499 |
Whole-genome CRISPRa libraries
| Product Name | No. of Genes | No. of gRNAs | Scale | Price (USD) | Reference |
|---|---|---|---|---|---|
| Human CRISPRa (SAM) Library | 23,430 | 70,290 | Medium | $4,099 | View |
| Plus | $4,599 | ||||
| Mouse CRISPRa (SAM) Library | 23,439 | 69,225 | Medium | $4,099 | |
| Plus | $4,599 |
Whole-genome CRISPRi libraries
| Product Name | No. of Genes | No. of gRNAs | Scale | Price (USD) | Reference |
|---|---|---|---|---|---|
| Human CRISPRi Library | 23,430 | 70,290 | Medium | $4,099 | View |
| Plus | $4,599 | ||||
| Mouse CRISPRi Library | 23,439 | 69,225 | Medium | $4,099 | |
| Plus | $4,599 |
Pathway-specific CRISPR knockout libraries
| Product Name | No. of Genes | No. of gRNAs | Scale | Price (USD) | Reference |
|---|---|---|---|---|---|
| DNA Damage Response Genes MKOv4 Library | 460 | 4,530 | Medium | $2,399 | View |
| Human Epigenetic Genes KO Library | 2,508 | 20,051 | Medium | $3,499 | View |
| Human Ubiquitination-Related Genes KO Library | 660 | 11,108 | Medium | $2,799 | View |
| Human Transcription Factors KO Library | 1,639 | 11,364 | Medium | $2,799 | View |
| Human Metabolic Genes KO Library | 2,981 | 30,290 | Medium | $3,499 | View |
| Human Kinase Domain-Focused KO Library | 482 | 3,051 | Medium | $2,399 | View |
| Human Messenger-RBP KO Library | 725 | 8,260 | Medium | $2,799 | View |
CRISPR lentivirus libraries의 스케일 및 titer
| Scale | Application | Titer | Volume |
|---|---|---|---|
| Medium | Cell culture & in vivo | >108 TU/ml | 1 ml (10x100 ul) |
| Plus | Cell culture & in vivo | >108 TU/ml | 5 ml (50x100 ul) |
기술적인 정보
제품 중점 사항
NGS를 통한 라이브러리 품질 검증
VectorBuilder의 라이브러리는 차세대 시퀀싱(NGS)을 통해 엄격한 검증을 거쳐 높은 리드 정렬 비율과 균일성으로 뛰어난 성능을 지속적으로 보여줍니다. 세심한 검증 프로세스를 통해 라이브러리가 정확할 뿐만 아니라 시퀀스 전반에 걸쳐 높은 수준의 일관성을 유지하도록 보장합니다.
확립된 렌티바이러스 시스템과 즉시 사용 가능한 고역가 렌티바이러스
VectorBuilder의 CRISPR 라이브러리는 다양한 세포에 대한 매우 효율적인 유전자 전달 시스템인 VSV-G 유사형 렌티바이러스로 제공됩니다. 렌티바이러스 벡터는 gRNA를 세포에 효율적이고 영구적이며 균일하게 도입할 수 있기 때문에 in vitro 내 유전자 스크리닝에 이상적입니다. 모든 풀링된 CRISPR 라이브러리는 고기능 역가 (>108 TU/ml)를 갖춘, 즉시 사용 가능한 렌티바이러스로 제공되므로 바이러스 패키징 및 역가 측정에 소요되는 시간을 절약할 수 있습니다. 3세대 렌티바이러스 벡터 시스템은 불완전한 자가 복제 기능으로 향상된 생물 안전성에 최적화되었습니다.
FAQ
이중 gRNA 라이브러리는 녹아웃 스크린을 위한 단일 gRNA 라이브러리보다 훨씬 더 강력합니다. 왜냐하면 이러한 라이브러리에 의한 대규모 삭제 도입은 기능 상실 돌연변이 생성에 훨씬 더 높은 효율성을 가질 수 있기 때문입니다. 이중 gRNA 라이브러리의 각 CRISPR 벡터에는 동일한 유전자를 표적으로 하는 한 쌍의 gRNA가 포함되어 있습니다. Cas9 발현 세포에 도입되면 각 벡터는 동일한 표적 유전자에 대해 두 개의 절단을 생성할 수 있습니다. 두 절단 부위의 부러진 끝 부분을 복구하려는 세포의 시도는 일반적으로 두 부위에 걸친 대규모 삭제로 이어집니다. 두 개의 절단 부위는 표적 유전자의 기능적으로 중요한 영역 측면에 위치하도록 설계되어 이들 부위에 걸친 결실이 유전자 기능의 손실을 초래할 가능성이 높습니다.
일반적인 녹아웃 스크린의 경우 풀링된 CRISPR 라이브러리는 1-벡터 또는 2-벡터 시스템 형식으로 구성될 수 있습니다. 1-벡터 시스템에서는 Cas9 또는 Cas9 변이체가 동일한 벡터의 gRNA와 함께 발현되는 반면, 2-벡터 시스템에서는 Cas9 또는 Cas9 변이체와 gRNA가 두 개의 별도 벡터에서 발현됩니다. 대안적으로, 2-벡터 시스템에서 gRNA 발현 벡터는 Cas9를 안정적으로 발현하는 세포주에 도입될 수 있습니다. 1-벡터 시스템을 사용하는 이점은 두 개의 서로 다른 벡터가 세포로 동시 형질감염/형질도입되는 것을 방지하고 Cas9 발현 안정 세포주의 가용성에 국한되지 않는다는 것입니다. 그러나 2-벡터 시스템에 비해 다용도가 낮고 복제 및 바이러스 패키징 효율성이 떨어질 수 있습니다.
VectorBuilder는 CRISPR 라이브러리 디자인(CLD)에 사용된 algorithm을 따라 gRNA의 특이성 점수를 계산합니다. 간단히 말하면, 종의 N(20)NGG 서열을 표적으로 삼도록 의도된 주어진 gRNA에 대해 우리는 해당 종의 게놈에서 표적 서열과 3 이하의 불일치가 있는 모든 잠재적인 비표적 부위를 검색합니다. 이러한 방식으로 식별된 각각의 잠재적인 off-target 부위에 대해 단일 off-target 점수가 계산됩니다. 그런 다음 모든 비표적 사이트에 대한 점수를 종합적으로 사용하여 gRNA의 최종 특이성 점수(0~100)를 계산하며, 값이 높을수록 표적 특이성이 높다는 것을 나타냅니.
특이도 점수는 대략적인 지침일 뿐이라는 점에 유의하세요. 실제 타겟팅 효율성과 특이성은 점수가 예측하는 것과 다를 수 있습니다. 점수가 낮은 gRNA도 여전히 잘 작동할 수 있습니다.