AAV Serotype Testing Panel

Adeno-associated virus (AAV)는 다양한 포유류 세포 유형에 transduction할 수 있는 능력과 숙주 생물체에서 immunogenicity가 낮기 때문에 유전자 치료에 가장 효과적인 바이러스 벡터로 부각되고 있다. VectorBuilder는 AAV serotype testing panel을 제공하여 사용자가 세포 또는 동물의 다양한 serotypes을 체계적으로 비교하여 특정 용도에 적합한 최적의 AAV serotype을 선택할 수 있도록 한다. AAV serotype testing panel은 프로젝트 요구 사항에 따라 18개의 serotype 컬렉션에서 3개 이상의 AAV serotype으로 AAV panel을 커스터마이징할 수 있는 유연성을 제공하는 유일한 상용 AAV serotype testing kit이다. 또한 AAV panel을 주문할 때 AAV-mediated EGFP 리포터 발현을 유도하기 위해 CAG 또는 CMV promoter 중에서 선택할 수 있는 옵션이 있어, panel 상에서 다양한 serotype의 성능을 매우 쉽고 효율적으로 모니터링하고 비교할 수 있다.

Ordering information

Product Catalog No. Titer & Volume Unit Price (USD) Availability
In vitro grade AAV serotype testing panel (CMV-EGFP) PANEL-AAVS01 ~1012 GC/ml, 25 ul, PBS buffer $59 per aliquot In stock
In vitro grade AAV serotype testing panel (CAG-EGFP) PANEL-AAVS02
In vivo grade AAV serotype testing panel (CMV-EGFP) PANEL-AAVSP01 ~1013 GC/ml, 25 ul, PBS buffer $109 per aliquot
In vivo grade AAV serotype testing panel (CAG-EGFP) PANEL-AAVSP02

Notes:

a. Our standard AAV serotype collection includes AAVs 1, 2, 3, 4, 5, 6, 6.2, 7, 8, 9, rh10, DJ, DJ/8, PHP.eB, PHP.S, AAV2-retro, AAV2-QuadYF and AAV2.7m8.

b. The AAVs packaged in this offering are ssAAVs. If you need scAAVs (self-complementary AAVs), please send a design request to us.

c. A minimum of three different serotypes is required for each panel. To customize and order your panel, please send a design request to us.

Technical information

AAV vector

AAV serotype testing panel에는 매우 최적화된 AAV 벡터 시스템을 사용하여 EGFP를 발현하는 premade AAV가 포함되어 있다. 사용자는 EGFP 발현을 유도하기 위해 CAG 또는 CMV promoter 중에서 선택할 수 있다. AAV 벡터 시스템은 E. coli에서 높은 카피 수 복제, 살아있는 바이러스의 고역가 패키징, 호스트 세포의 효율적인 transduction 및 높은 수준의 transgene 발현에 최적화되어 있다. AAV 벡터는 알려진 모든 capsid serotype을 사용하여 바이러스로 패키징될 수 있으며, 매우 높은 transduction 효율이 가능하며, 안전성 리스크가 낮다.

Figure 1. Maps of EGFP-expressing AAV vectors with (A) CMV promoter or (B) CAG promoter.
Tissue tropism of AAV serotypes

AAV의 많은 종이 실제로 확인되었다. 바이러스 표면에 있는 capsid 단백질의 다른 항원성을 기초로 다른 serotype으로 나뉜다. 다른 serotype은 바이러스를 다른 tissue tropism (즉, tissue specificity of infection)으로 만들 수 있다. AAV 벡터가 바이러스로 패키징될 때, 패키징에 다른 capsid 단백질을 사용함으로써 바이러스에 다른 serotype이 부여될 수 있다. AAV serotype testing panel은 여러 AAV serotype의 tissue specificity를 체계적으로 비교하도록 디자인되어 있어 실험에 적합한 최적의 serotype을 선택하는데 도움이 된다. 아래 표에는 다른 AAV serotype이 부여한 tissue specificity가 나열되어 있다.

List by Serotype
List by Tissue Type
Serotype Tissue tropism
AAV1 Smooth muscle, CNS, lung, retina, inner earpancreas, heart, liver
AAV2 Smooth muscle, CNS, liver, kidney, retina, inner ear
AAV3 Smooth muscle, liver, lung
AAV4 CNS, retina, lung, kidney
AAV5 Smooth muscle, CNS, lung, retina
AAV6 Smooth muscle, heart, lung, adipose, liver
AAV6.2 Lung, liver, inner ear
AAV7 Smooth muscle, retina, CNS, liver
AAV8 Smooth muscle, CNS, retina, inner earliver, pancreas, heart, kidney, adipose
AAV9 Smooth muscle, lung, liver, heart, pancreas, CNS, retina, inner ear, testes, kidney
AAVrh10 Smooth muscle, lung, liver, heart, pancreas, CNS, retina, kidney
AAV-DJ Liver, heart, kidney, spleen
AAV-DJ/8 Liver, brain, spleen
AAV-PHP.eB CNS
AAV-PHP.S PNS
AAV2-retro Spinal nerves 
AAV2-QuadYF Endothelial cell
AAV2.7m8 Retina, inner ear
Tissue type Recommended AAV serotypes
Smooth muscle AAV1, AAV2, AAV3, AAV5, AAV6, AAV7, AAV8, AAV9, AAVrh10
CNS AAV1, AAV2, AAV4, AAV5, AAV7, AAV8, AAV9, AAVrh10, AAV-PHP.eB
PNS AAV-PHP.S
Brain AAV1, AAV2, AAV5, AAV7, AAV8, AAV-DJ/8
Retina AAV1, AAV2, AAV4, AAV5, AAV7, AAV8, AAV9, AAVrh10, AAV2.7m8
Inner ear AAV1, AAV2, AAV6.2, AAV8, AAV9, AAV2.7m8
Lung AAV1, AAV3, AAV4, AAV5, AAV6, AAV6.2, AAV9, AAVrh10
Liver AAV1, AAV2, AAV3, AAV6, AAV6.2, AAV7, AAV8, AAV9, AAVrh10, AAV-DJ, AAV-DJ/8
Pancreas AAV1, AAV2, AAV6, AAV8, AAV9, AAVrh10
Heart AAV1,AAV4, AAV5, AAV6, AAV8, AAV9, AAVrh10, AAV-DJ
Kidney AAV2, AAV4, AAV8, AAV9, AAVrh10, AAV-DJ, AAV-DJ/8
Adipose AAV6, AAV8, AAV9
Testes AAV2, AAV9
Spleen AAV-DJ, AAV-DJ/8
Spinal nerves AAV2-retro
Endothelial cells AAV2-QuadYF