Library 제작

VectorBuilder는 대규모 기능적 스크리닝을 위한 복잡한 library의 디자인과 제작에 대한 풍부한 경험을 보유하고 있습니다. VectorBuilder는 유전자 기능 탐색, CRISPR 또는 RNAi 스크리닝 수행, 조절요소(regulatory element), 세포 계통 분석 수행 등의 연구 목표에 맞는 고품질 라이브러리를 제공하기 위해 최선을 다하고 있습니다. VectorBuilder의 library는 NGS를 통해 검증되어 결과를 정확히 알 수 있습니다.

Premade Pooled Libraries

Library 제작 워크플로우

workflow for library construction
Library 디자인

최적화된 라이브러리를 디자인하는 것은 성공적인 스크리닝 실험에 매우 중요합니다. VectorBuilder의 기술팀은 효율적이고 오류 없는 클로닝 프로세스와 호환되며, 다양한 후속 스크리닝 실험을 위한 적절한 마커나 바코드 서열을 포함하고, 확실한 결과를 위해 높은 signal-to-noise ratio를 갖는 라이브러리 벡터를 디자인하는데 도움을 드릴 수 있습니다. 연구 요구 사항에 따라 렌티바이러스, AAV, piggyBac, 비바이러스 일반 플라스미드, 및 아데노바이러스 등 검증된 다양한 전달 시스템 중에서 선택할 수 있습니다.

CRISPR 또는 RNAi 스크린의 경우, VectorBuilder는 확립된 알고리즘 및 계산 파이프라인을 사용하여 표적 유전자 또는 게놈 영역 목록에 대한 gRNA 또는 shRNA 서열을 디자인하는데 도움을 줄 수 있습니다. 2 vector CRISPR 라이브러리의 경우 당사는 연구자의 스크리닝 전략에 적합한  Cas9 발현 벡터를 제작하고 패키징 할 수도 있습니다.

Pooled library 클로닝

벡터 백본에 삽입할 DNA 변이체를 얻기 위해 새로운 oligo 합성, 유도 진화 또는 여러 방법을 조합한 접근법을 사용할 수 있습니다. 변이체는 최소 cycle로 PCR 증폭하고 높은 coverage로 원하는 벡터 백본에 병렬로 클로닝됩니다. 라이브러리 플라스미드가 삽입된 E. coli glycerol 스톡을 만듭니다. 바이러스 패키징을 진행하기 전 라이브러리의 coverage와 균일성을 평가하기 위해 플라스미드 풀에서 NGS 분석을 수행합니다.

Pooled library의 바이러스 패키징

렌티바이러스 또는 AAV 같은 바이러스 형질도입을 통해 풀링된 라이브러리를 세포에 전달해야 할 수도 있습니다. VectorBuilder는 역가, 순도 및 균일성 측면에서 풀링된 라이브러리의 바이러스 패키징 프로토콜을 크게 개선한 다양한 독점 기술과 시약을 개발했습니다. 당사는 스크리닝 실험에 바로 사용할 수 있는 바이러스 라이브러리를 제공할 수 있습니다.

Click to view more information of virus packaging services  
NGS deconvolution

VectorBuilder는 풀링된 라이브러리 스크리닝 시 NGS로 분석하는데 도움을 줄 수 있습니다. 고객의 시료인 게놈 DNA를 보내면 당사는 NGS 라이브러리를 준비해 시퀀싱을 수행하고 데이터를 분석해서, 단 몇 주 안에 각 샘플의 정확한 리드 수(read count)를 제공해 드립니다.

서비스 세부 사항

가격 및 소요시간 Price Match
Service Module Brief Description Price (USD) Turnaround
Library 디자인 CRISPR, RNAi, 바코드, enhancer/프로모터, 돌연변이, AAV capsid 및 기타 풀링된 라이브러리를 위한 라이브러리 벡터 백본. Free 1-4 days

Pooled library 클로닝(올리고 합성과 NGS 검증 포함)

DNA 변이체를 원하는 벡터 백본으로 대량의 병렬 클로닝(massive parallel cloning)을 한 후 Sanger 시퀀싱을 통한 예비 QC와 NGS를 통한 전체 QC가 진행됩니다. 결과물은 E. coli glycerol 스톡으로 제공됩니다

.
From $2,300 5-8 weeks
Pooled library의 바이러스 패키징 바이러스 패키징 서비스에 대한 자세한 정보는 여기를 클릭하십시오. 라이브러리 패키징 가격은 단일 벡터 패키징 가격의 1.5배입니다.
스크리닝 후 샘플의 NGS deconvolution 스크리닝 된 세포의 게놈 DNA에서 NGS 라이브러리 준비, Illumina 시퀀싱 (>500x coverage) 및 데이터 분석이 포함됩니다. From $320 per sample 3-5 weeks
문서 자료
브로셔 & 리플렛

주문 방법

고객이 제공하는 library plasmid pool

고객이 제공하는 플라스미드 풀을 사용하는 경우 시료 제출 가이드라인에 따라 준비하여 보내주십시오. 시료의 손상이나 배송 지연을 방지하려면 배송 가이드라인을 따라 주시기 바랍니다. 고객이 제공하는 시료는 당사의 필수 QC를 거치며 각 항목에 대해 추가 $100의 요금이 부가될 수 있습니다. 고객이 제공한 시료는 QC를 통과한 후 생산이 시작됩니다. 고객이 제공한 플라스미드 풀에 대해서는 라이브러리의 복잡성이나 균일성에 대해 보장하지 않습니다.

디자인 서포트 의뢰하기