벡터 구성 요소에 이름을 부여하는 규칙(예: promoters, ORFs or linkers)

  • VectorBuilder의 구성 요소 컬렉션: 구성 요소의 일반적인 이름이 사용됩니다.
    Example: CMV, EGFP, Neo

  • VectorBuilder의 유전자 기반 데이터베이스에서 검색된 ORF:l  ORF 이름은 유전자 기호 뒤에 괄호화된 RefSeq accession (또는 RefSeq 주석이 없는 종은 gene ID)으로 구성됩니다. 종 약어는 소문자로 유전자 기호 앞에 위치합니다.

    • Human, mouse, rat은 각각 "h", "m", "r"이라는 한글자의 약어로 부여됩니다.
    • 주요 생물종은 두 글자의 약어가 할당됩니다. 예를 들어 cat은 "ct"이고 chimpanzee는 "ch"이고 dog은 "dg"입니다.
    • 그 외의 생물 종은 그들의 학명을 세 글자로 약칭하고, 그 뒤에 밑줄(_)을 씁니다. 약칭의 첫 글자는 속명의 첫 글자에 해당하며, 약칭의 두번째, 세번째 글자는 종명의 처음 두 글자에 해당합니다. 예를 들어, Drosophila melanogaster는 "dme_"입니다.
    Example of a human ORF from NCBI RefSeq collection: hRHO[NM_000539.3]
    Example of a mouse ORF from VectorBuilder ORF collection: mRho[ORF032112]
    Example of a Drosophila melanogaster ORF from NCBI RefSeq collection: dme_w[NM_057439.2]
    Example of E. coli ORF from NCBI: eco_nhaA[944758]
  • 사용자가 붙여넣은 서열: 사용자는 벡터에 서열을 추가하려면 붙여넣은 서열의 이름을 정의해야 합니다. 사용자가 정의한 이름은 괄호 안에 표시됩니다. 사용자가 붙여넣은 서열이 VectorBuilder 데이터베이스의 구성 요소와 서열이 100% 동일한 경우는, VectorBuilder 구성 요소의 공식 이름으로 자동 설정된다는 점에 유의하십시오.
    Example of a user pasted component: {MyGene}

  • 사용자가 편집한 VectorBuilder 데이터베이스의 ORF: 사용자가 VectorBuilder의 ORF 데이터베이스에서 검색한 ORF를 편집하여 mutation을 도입하면, 공식 ORF 이름 옆에 *가 자동으로 추가되어 ORF 서열이 mutation되었음을 나타냅니다. 그런 다음 사용자는 이 이름을 사용하거나 다른 이름으로 변경할 수 있습니다. 사용자가 이름을 변경하기로 선택한 경우, 괄호가 추가되어 사용자가 이름을 정의했음을 표시합니다. Add Tag 기능으로 ORF에 추가된 epitope tags는 mutation으로 간주되지 않습니다.
    Example of an ORF from VectorBuilder’s database that is edited by user: hRHO[NM_000539.3]* for automatically assigned name, which can be changed by the user to another name such as {MyGene}

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